Về hợp tác trong nước, Khoa có hợp tác với các trường đại học (ĐHKHXH&NV Thành phố Hồ Chí Minh, Đại học Luật Hà Nội, Đại học Sư phạm Hà Nội, Học viện Chính trị - Bộ Quốc phòng); các cơ quan nhà nước (Viện Tâm lý học, Viện Sức khỏe tâm thần – bệnh viện Bạch Mai, Bệnh Viện Nhi trung ương, Bệnh viện Tâm thần Trung ương 1, Bệnh viện E, Bệnh viện tâm thần ban ngày Mai Hương, Học viện Khoa học Xã hội, ...) và các tổ chức khác (Hội Tâm lý học Việt Nam,...). Đây là nguồn lực quan trọng để Khoa có thể huy động đội ngũ giảng viên kiêm nhiệm, thỉnh giảng trình độ cao, đáp ứng được yêu cầu đào tạo của Khoa. Đồng thời, đây cũng là điều mấu chốt để sinh viên của Khoa có thể có được các cơ hội thực tập, hành nghề tại các tổ chức có uy tín trong nước.
Về hợp tác quốc tế, khoa có hợp tác với Đại học Toulouse Jean Jaures (Pháp), Đại học Gdansk (Ba Lan), Đại học Texas (Mỹ), Đại học Aix-Marseille (Pháp), Viện Marie-Haps (Bỉ),... Thông qua các hợp tác quốc tế, nhiều nghiên cứu xuyên văn hóa đã được thực hiện, nhiều hội thảo khoa học quốc tế đã được tổ chức. Đặc biệt, với chương trình hợp tác với các nhà Tâm lý học Pháp, Khoa đã góp phần xây dựng và phát triển mạng lưới  các nhà thực hành Tâm lý lâm sàng trẻ em và thanh thiếu niên ở Hà Nội.
Kết quả của những hoạt động hợp tác này là sự ra đời chuyên ngành đại học Pháp ngữ Tâm lý học Lâm sàng vào tháng 10/2001, tạo nên một sắc thái hoàn toàn khác biệt so với các CTĐT ngành Tâm lý học ở các cơ sở đào tạo đại học trong cả nước. Như vậy, có thể nói, Khoa Tâm lý học, Trường ĐHKHXH&NV, ĐHQGHN là cơ sở tiên phong, đi đầu trong đào tạo thực hành tâm lý lâm sàng bậc đại học tại Việt Nam.